Я бы бекапил все, что нужно для работы сайта. Т.е. вот чтобы в случае ядерной войны в одной, отдельно взятой серверной, можно было запустить сайт в другой серверной. Но для этого не нужно так уж все бекапить. Только сделанное собственными руками или набранное в базу. Что значит wordpress бекапить? Сам пакет вряд ли нужно бекапить, а вот то, что под него сделано, видимо нужно. Но оно же не меняется день ото дня? Поставить какую-нибудь versioning system и складывать туда то, что сделано под wordpress. Ну и бекап базы. И в случае чего это все разворачивается в другом месте.